離心柱法主要是利用離心柱中的硅膠基質吸附RNA,再通過洗滌去除雜質從而得到RNA的一種常用方法。相較于Trizol法,離心柱法因操作簡便、耗時短、純度高等優點而得到廣泛應用,但也因其吸附柱規格的限制在大批量操作時具有一定的局限性,此外,針對特殊的樣本,其提取的效果也大不如Trizol法好。那么你知道柱式法RNA提取的實驗流程和注意事項是什么嗎?讓我們一起來看看吧!
一、主要的試劑、儀器與耗材
RNA提取試劑盒、氯仿、無水乙醇、RNase free Water、低溫冷凍離心機、勻漿器或組織研磨器、微量移液器、通風櫥、計時器、1.5ml EP管、2ml EP管等。
二、 提取步驟
1.樣品處理:
· 細胞:貼壁細胞每106細胞加入1ml裂解液,吹打混勻。
· 懸浮細胞:植物、動物、酵母每10^6細胞加入1ml裂解液。
· 細菌細胞每107細胞加入1ml裂解液混勻。
· 組織:新鮮或-70℃凍存100mg組織加1ml裂解液,勻漿處理。
2.室溫放置5min,使核酸蛋白復合物分離;
3.向勻漿樣品中加入0.2ml的氯仿,蓋好管蓋,劇烈振蕩15s,室溫放置3-5min;
4.2-8℃,12000rpm離心10min。RNA主要存在于上層水相中把水相轉移至新的EP管中(注:不可吸到沉淀);
5.吸附柱前處理:在吸附柱中加入500ul洗柱液,室溫放置2min,2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液(小Tips:此步可以在第四步離心還剩2min左右的時候進行,這樣第四步離心結束就可以直接進行洗柱,而不需要再等時間);
6.在收集的上清中加入200ul無水乙醇混勻,加入吸附柱中靜置2min,2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液;
7.向吸附柱中加入600ul漂洗液(注:新買的試劑盒中漂洗液還需要加入一定量的無水乙醇,此步一定要確認漂洗液是否加入無水乙醇),2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液;
8.向吸附柱中加入600ul漂洗液,2-8℃,12000rpm離心2min,棄廢液(注:漂洗液在7-8步共加了兩次哦);
9.12000rpm離心2min,棄掉收集管,將吸附柱置于室溫數分鐘(10-15min)以去除殘留的漂洗液(注:最好在通風櫥進行,以免RNA酶對RNA的降解;通風櫥在使用前也可先紫外30min);
10.將吸附柱放入新管中,向膜中央滴加50-100ul RNase free ddH2O(通常取中間值),室溫放置5min,12000rpm室溫離心2min即可得到RNA溶液(注:所有步驟中僅最后一步離心是在室溫,其余均在2-8℃,因此,前幾步離心拿出樣品后一定要及時關上離心機蓋子,以免升溫,而在第9步離心結束后就可以打開離心機蓋子使其快速升至室溫)。
三、 注意事項
1.佩戴手套、口罩,消毒操作臺,杜絕外源酶的污染;
2.所用試劑耗材必須無酶化,有條件者可以直接購買,否則就要做好高壓滅菌的工作;
3.得到RNA溶液后可保存于-80℃,避免反復凍融,放置時間不可過長;4.對于組織RNA的提取,一定要充分勻漿處理以使RNA充分釋放出來。
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